特克斯县地处亚欧大陆腹地，四面环山，处于逆温带控制区，是典型的北温带大陆性气候，年均气温8.4℃（月均最低气温-21.7℃、月均最高气温35.5℃），年均降水量441.1mm，年平均风速为1.7米/秒，日照2628.4小时。年均相对湿度59%。特克斯县93%的面积为丘陵和山地，县城海拔900—1200米，南部天山主脊海拔高度4902米，北部乌孙山海拔3500米。县域共有18条河流，特克斯河与巩乃斯河、喀什河等交汇形成伊犁河。